MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 3998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015851	GCA	2	6	60907	60912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783688
1002	NC_015851	CGC	2	6	61093	61098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783688
1003	NC_015851	ACC	2	6	61117	61122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783688
1004	NC_015851	CGC	2	6	61230	61235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783688
1005	NC_015851	GCG	2	6	61259	61264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783688
1006	NC_015851	GCAT	2	8	61276	61283	25 %	25 %	25 %	25 %	340783688
1007	NC_015851	TAC	2	6	61380	61385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783688
1008	NC_015851	GA	3	6	61518	61523	50 %	0 %	50 %	0 %	340783688
1009	NC_015851	CGA	2	6	61532	61537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783688
1010	NC_015851	TC	3	6	61578	61583	0 %	50 %	0 %	50 %	340783688
1011	NC_015851	CGCC	2	8	61584	61591	0 %	0 %	25 %	75 %	340783688
1012	NC_015851	GGA	2	6	61733	61738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783688
1013	NC_015851	AAT	2	6	61780	61785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783688
1014	NC_015851	GGC	2	6	61827	61832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783688
1015	NC_015851	GT	3	6	61897	61902	0 %	50 %	50 %	0 %	340783688
1016	NC_015851	CAGGG	2	10	61920	61929	20 %	0 %	60 %	20 %	340783688
1017	NC_015851	GCG	2	6	61988	61993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783688
1018	NC_015851	GAA	2	6	61995	62000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783688
1019	NC_015851	CAC	2	6	62103	62108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783688
1020	NC_015851	ATG	2	6	62179	62184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783688
1021	NC_015851	CGT	2	6	62186	62191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783688
1022	NC_015851	CCA	2	6	62192	62197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783688
1023	NC_015851	GATGGC	2	12	62295	62306	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340783688
1024	NC_015851	CAG	2	6	62376	62381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783688
1025	NC_015851	GCC	2	6	62461	62466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783688
1026	NC_015851	CTC	2	6	62538	62543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783688
1027	NC_015851	TGG	2	6	62576	62581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783688
1028	NC_015851	CCG	2	6	62584	62589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783688
1029	NC_015851	TGGC	2	8	62591	62598	0 %	25 %	50 %	25 %	340783688
1030	NC_015851	GCC	2	6	62605	62610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783688
1031	NC_015851	GCG	2	6	62683	62688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783688
1032	NC_015851	TCC	2	6	62734	62739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783688
1033	NC_015851	GCCC	2	8	62745	62752	0 %	0 %	25 %	75 %	340783688
1034	NC_015851	C	6	6	62750	62755	0 %	0 %	0 %	100 %	340783688
1035	NC_015851	ACG	2	6	62785	62790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783688
1036	NC_015851	AGC	2	6	62914	62919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783688
1037	NC_015851	TCA	2	6	62942	62947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783688
1038	NC_015851	GTCC	2	8	63096	63103	0 %	25 %	25 %	50 %	340783688
1039	NC_015851	GCC	2	6	63214	63219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783688
1040	NC_015851	ACC	2	6	63256	63261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783688
1041	NC_015851	GAT	2	6	63351	63356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783688
1042	NC_015851	CGG	2	6	63485	63490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783689
1043	NC_015851	CAC	2	6	63533	63538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783689
1044	NC_015851	TAGA	2	8	63635	63642	50 %	25 %	25 %	0 %	340783689
1045	NC_015851	CAC	2	6	63683	63688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783689
1046	NC_015851	GCG	2	6	63715	63720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783689
1047	NC_015851	GCG	2	6	63808	63813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783689
1048	NC_015851	CGG	2	6	63875	63880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783689
1049	NC_015851	CGG	2	6	63902	63907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783689
1050	NC_015851	CAT	2	6	63928	63933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783689
1051	NC_015851	G	6	6	63955	63960	0 %	0 %	100 %	0 %	340783689
1052	NC_015851	C	6	6	63984	63989	0 %	0 %	0 %	100 %	340783689
1053	NC_015851	GGC	2	6	64031	64036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783689
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1055	NC_015851	GCC	2	6	64089	64094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783689
1056	NC_015851	GCA	2	6	64164	64169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783689
1057	NC_015851	CCTG	2	8	64191	64198	0 %	25 %	25 %	50 %	340783689
1058	NC_015851	GCG	2	6	64206	64211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783689
1059	NC_015851	GC	3	6	64286	64291	0 %	0 %	50 %	50 %	340783689
1060	NC_015851	GCCTGC	2	12	64320	64331	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340783689
1061	NC_015851	GCC	2	6	64412	64417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783689
1062	NC_015851	GC	4	8	64514	64521	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
1063	NC_015851	GA	3	6	64564	64569	50 %	0 %	50 %	0 %	340783690
1064	NC_015851	TTG	2	6	64621	64626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783690
1065	NC_015851	GGC	2	6	64639	64644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783690
1066	NC_015851	GCA	2	6	64715	64720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783690
1067	NC_015851	ACG	2	6	64811	64816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783690
1068	NC_015851	CTGA	2	8	64819	64826	25 %	25 %	25 %	25 %	340783690
1069	NC_015851	GCG	2	6	64853	64858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783690
1070	NC_015851	GC	3	6	64861	64866	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
1071	NC_015851	TTC	2	6	64870	64875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783690
1072	NC_015851	CAG	2	6	64921	64926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783690
1073	NC_015851	ACA	2	6	64941	64946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783690
1074	NC_015851	ACC	2	6	64956	64961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783690
1075	NC_015851	CTT	2	6	64971	64976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783690
1076	NC_015851	CGG	3	9	65046	65054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783690
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1082	NC_015851	GGC	3	9	65248	65256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783690
1083	NC_015851	CG	3	6	65477	65482	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
1084	NC_015851	C	6	6	65517	65522	0 %	0 %	0 %	100 %	340783690
1085	NC_015851	CCG	2	6	65529	65534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783690
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1090	NC_015851	GC	3	6	65821	65826	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
1091	NC_015851	GGC	2	6	65833	65838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783690
1092	NC_015851	CG	3	6	65862	65867	0 %	0 %	50 %	50 %	340783690
1093	NC_015851	ACG	2	6	66544	66549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783691
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1097	NC_015851	GAG	2	6	67091	67096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783692
1098	NC_015851	GAA	2	6	67111	67116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783692
1099	NC_015851	CGC	2	6	67173	67178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783692
1100	NC_015851	AC	3	6	67179	67184	50 %	0 %	0 %	50 %	340783692
1101	NC_015851	ACC	4	12	67193	67204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783692
1102	NC_015851	CCG	2	6	67221	67226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783692
1103	NC_015851	CTTG	2	8	67228	67235	0 %	50 %	25 %	25 %	340783692
1104	NC_015851	TGG	2	6	67239	67244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783692
1105	NC_015851	GGA	2	6	67306	67311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783692
1106	NC_015851	GCA	2	6	67340	67345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783692
1107	NC_015851	GCG	2	6	67376	67381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783692
1108	NC_015851	CGG	2	6	67432	67437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783692
1109	NC_015851	CCAG	2	8	67455	67462	25 %	0 %	25 %	50 %	340783692
1110	NC_015851	CCAC	2	8	67482	67489	25 %	0 %	0 %	75 %	340783692
1111	NC_015851	TGG	2	6	67635	67640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783692
1112	NC_015851	G	6	6	67729	67734	0 %	0 %	100 %	0 %	340783692
1113	NC_015851	CCG	2	6	67749	67754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783692
1114	NC_015851	CTG	2	6	67778	67783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783692
1115	NC_015851	GCT	2	6	67843	67848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783692
1116	NC_015851	GC	3	6	67850	67855	0 %	0 %	50 %	50 %	340783692
1117	NC_015851	GCAG	2	8	67903	67910	25 %	0 %	50 %	25 %	340783692
1118	NC_015851	CGG	2	6	68014	68019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783692
1119	NC_015851	GCGG	2	8	68062	68069	0 %	0 %	75 %	25 %	340783692
1120	NC_015851	ACT	3	9	68141	68149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783692
1121	NC_015851	CAT	2	6	68150	68155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783692
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1123	NC_015851	GCG	2	6	68179	68184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783692
1124	NC_015851	GGA	2	6	68224	68229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783692
1125	NC_015851	CGC	2	6	68230	68235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783692
1126	NC_015851	TGCGC	2	10	68475	68484	0 %	20 %	40 %	40 %	340783693
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